P1作用是懸菌，使菌體分散P2是強堿，作用是裂解菌體大提質粒和小提質粒的基本原理是一樣的，都是通過一定的方法如加堿裂解使在細菌內大量擴增的質粒釋放出來，經過去蛋白去RNA等一系列步驟純化DNA，最終將DNA提取出來配方是1 MolL TrisHclpH80 25mL 05MolL EDTANaOHpH。

質粒提取是分子生物學中一項基本且簡易的實驗操作流程遵循試劑盒指南，無需復雜思考，僅需機械執行質粒提取的成功與否，直接影響后續實驗的成敗，因此提高質粒提取質量至關重要實驗中通常會使用到P1P2N3PEEB等不同溶液，而這些溶液在質粒提取過程中的具體作用與配方構成也是一門學問接下來。

三基因組DNA分子很大鏈很長，在起初的蛋白質沉淀時，絕大部分已經纏繞在一起沉淀下去了，此外，試劑盒中套管中的纖維膜只能特異的吸附幾百至幾千bp的DNA片段，小的不能吸附，大的不能被洗脫下去，因此可以很好分離大分子量的基因組DNA和較小分子量的質粒DNAwash buffer其實是70%的無水乙醇，其目的。